Ecologie et Physiopathologie des Protozoaires Intestinaux

INSERM U1019 – CNRS UMR9017 – Université de Lille – CHU Lille – Institut Pasteur de Lille

Présentation

L’équipe ECOPHIP dirigée par le Dr Eric VISCOGLIOSI (Directeur de Recherche au CNRS) concentre ses activités de recherche sur les protozoaires parasites intestinaux Blastocystis et Cryptosporidium, qui représentent des problèmes socio-économiques et de santé publique majeurs. Ces deux parasites sont responsables d’infections gastro-intestinales qui, dans le cas de Cryptosporidium, peuvent être graves voire mortelles chez les enfants et les patients immunodéprimés. Cependant, ces protozoaires sont encore peu étudiés et généralement négligés par les autorités sanitaires, alors que peu ou pas de traitements sont efficaces contre ces parasites. Les travaux actuels et futurs d’ECOPHIP, qui ont la particularité de combiner “études de terrain” et “recherche en laboratoire”, visent à clarifier l’épidémiologie moléculaire de ces parasites et leur circulation dans les populations humaines et animales ainsi que dans l’environnement (recherche des facteurs de risque de transmission) tout en identifiant les mécanismes impliqués dans la pathogénèse de ces parasites. L’objectif d’ECOPHIP est de proposer des stratégies pour mettre en œuvre des mesures de prévention et de contrôle afin de réduire l’incidence de ces parasites.

Actus

ECOPHIP a une reconnaissance internationale dans le domaine de la parasitologie et de l’écologie de la santé comme en témoigne sa production scientifique, en particulier concernant les parasites intestinaux Blastocystis et Cryptosporidium. Elle a ainsi contribué, ces dernières années, à une meilleure connaissance de l’épidémiologie moléculaire, de la transmission et de la pathogénie de ces microorganismes. Par exemple, les nombreuses enquêtes à grande échelle menées en Afrique et au Moyen-Orient comme en Europe ont mis en avant l’importante circulation de Blastocystis dans la population humaine et ont permis d’identifier les principaux réservoirs animaux de transmission zoonotique. Sa pathogénicité et son potentiel invasif ont été confirmés à travers l’étude de cas cliniques. Le développement d’approches de protéomique et de génomique ont permis d’ébaucher un schéma des mécanismes impliqués dans sa virulence.

Par ailleurs, ECOPHIP a aussi mis en évidence l’impact positif de Blastocystis sur le microbiote intestinal de l’hôte. L’étude du rôle de ce parasite sur la santé humaine et animale est actuellement soutenue par la Région Hauts-de-France (financement projet exploratoire STIMulE) et par la SATT Nord (programme de co-maturation).

ECOPHIP a aussi été la première à démontrer l’implication de Cryptosporidium dans le développement de cancers digestifs dans des modèles expérimentaux in vivo et ex vivo ce qui est d’ailleurs confirmé chez l’Homme à travers plusieurs études épidémiologiques. L’infection d’explants coliques humains par le parasite est donc en cours avec le soutien financier de l’Université Catholique de Lille. L’ensemble de ces résultats a poussé l’équipe à concentrer nos recherches sur l’identification de la signature moléculaire du cancer digestif induit par ce parasite. Les chercheurs explorent en particulier le rôle de Cryptosporidium dans l’épigénétique du cancer (Financement : Plan cancer INSERM) et les voies de signalisation potentiellement impliquées dans cette induction (Financement : Bonus H CHU de Lille) à travers différentes approches comme la transcriptomique et la génomique comparative.

En parallèle, l’équipe teste différents inhibiteurs pouvant cibler Cryptosporidium (Financement : Programme inter-équipes CIIL). ECOPHIP interagit aussi activement avec son environnement social et économique à travers ses activités d’expertise et a une forte attractivité comme l’attestent ses collaborations nationales et internationales et l’accueil de nombreux étudiants étrangers de différents niveaux universitaires.

En savoir plus : www.ciil.fr/fr

Membres

Eric VISCOGLIOSI
Directeur de recherche CNRS, responsable d’équipe

Magali CHABE
Maître de conférences, Université de Lille

Gabriela CERTAD
Chargée de Recherche, Université Catholique de Lille

Sadia BENAMROUZ-VANNESTE
Chargée de Recherche, Université Catholique de Lille

Pierre GOSSET
Praticien Hospitalier, Université Catholique de Lille

Adriana MIHALACHE
Praticien Hospitalier, Université Catholique de Lille

Nausicaa GANTOIS
Ingénieur d’Etude, Institut Pasteur de Lille

Jérémy DESRAMAUT
Technicien de Recherche, Institut Pasteur de Lille

Manasi SAWANT
Doctorante

Salma KHALED
Doctorante

Timothé GUILAVOGUI
Doctorant

Muriel KHALIL
Etudiante en Master 2

Publications

Audebert C, Bonardi F, Caboche S, Guyot K, Touzet H, Merlin S, Gantois N, Creusy C, Meloni D, Mouray A, Viscogliosi E, Certad G, Benamrouz-Vanneste S, Chabé M (2020).
Genetic basis for virulence differences of various Cryptosporidium parvum carcinogenic isolates.
Sci Rep 10: 7316

Certad G, Follet J, Gantois N, Hammouma-Ghelboun O, Guyot K, Benamrouz-Vanneste S, Fréalle E, Seesao Y, Delaire B, Creusy C, Even G, Verrez-Bagnis V, Ryan U, Gay M, Aliouat-Denis CM, Viscogliosi E (2019).
Prevalence, molecular identification, and risk factors for Cryptosporidium infection in edible marine fish: a survey across sea areas surrounding France.
Front Microbiol 10: 1037

Certad G, Viscogliosi E, Chabé M, Caccio S (2017).
Pathogenic patterns of Cryptosporidium and Giardia.
Trends Parasitol 33: 561-576

Baydoun M, Benamrouz-Vanneste S, Creusy C, Guyot K, Gantois N, Chabé M, Delaire B, Mouray A, Baydoun A, Forzy G, Chieux V, Gosset P, Senez V, Viscogliosi E, Follet J, Certad G (2017).
Three-dimensional (3D) culture of adult murine colon as an in vitro model of cryptosporidiosis: proof of concept.
Sci Rep 7: 17288

Audebert C, Even G, Cian A, The Blastocystis Investigation Group, Loywick A, Merlin S, Viscogliosi E, Chabé M (2016).
Colonization with the enteric protozoa Blastocystis is associated with increased diversity of human gut bacterial microbiota.
Sci Rep 6 : 25255

Fréalle E, El Safadi D, Cian A, Aubry E, Certad G, Osman M, Wacrenier A, Dutoit E, Creusy C, Dubos F, Viscogliosi E (2015).
Acute Blastocystis-associated appendicular peritonitis in a child, Casablanca, Morocco.
Emerg Infect Dis 21: 91-94

Mots-clés

Protozoaires intestinaux ; Blastocystis ; Cryptosporidium ; Epidémiologie moléculaire ; Transmission ; Pathogénicité ; Troubles digestifs ; Microbiote intestinal; Cancer ; OMICs ; Epigénétique ; Drogues ; Modèles in vitro, in vivo et ex vivo

Contact équipe

Dr Eric Viscogliosi
Directeur de Recherche au CNRS, Responsable de l’équipe ECOPHIP

eric.viscogliosi@pasteur-lille.fr
03 20 87 79 61