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de Transcriptomique et Génomique Appliquée
de l'Institut Pasteur de Lille.
Le laboratoire fait partie du Pôle Recherche de l'Institut Pasteur de Lille. Il est également rattaché au Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL) ainsi qu'à l' IFR142.
L'activité du laboratoire fait partie intégrante de l'effort de recherche mené par l'Institut Pasteur de Lille dans le domaine de la santé humaine.
NOS APPLICATIONS COMPLETES
Le laboratoire de Transcriptomique et Génomique Appliquée propose une gamme de solutions
adaptée à vos travaux en génomique :
Etude de la modulation de transcription des gènes dans les systèmes eucaryotes ou procaryotes.
Mesure et comparaison des niveaux d'expression de l'ensemble des gènes d'un génome entre une ou plusieurs conditions d'étude et une condition de référence.
La génomique comparative est une approche permettant d’étudier la composition et la structure des génomes. Elle passe par la comparaison du ou des génomes étudiés à un génome de référence en utilisant la technologie des « microarrays ».
Bénéficiant de l’accroissement constant du nombre de génomes séquencés, la génomique comparative s’impose comme un outil essentiel dans l’identification et la compréhension des effets de la sélection génomique sur l'organisation et l'évolution des génomes.
Les études de type « DNA binding protein » permettent de définir les sites de fixation de protéines interagissant avec la molécule d’ADN (facteurs de transcription, histone, répresseurs, …). Le principe des ces études est fondé sur l’identification des séquences génomiques interagissant avec la protéine étudiée par co-immunoprécipitation suivie d’une hybridation sur « microarray » (ChIP-chip) ou d’un séquençage des fragments obtenus (ChIP-seq). L'originalité et l'intérêt de cette méthode réside dans le fait que l’étude de l’interaction ADN-protéine se fait in vivo à un instant donné, ce qui permet d'avoir une idée réaliste des processus mis en œuvre dans la cellule.
Etude de la méthylation de l’ADN en système Eucaryote.
Mesure et comparaison de l’état de méthylation au niveau des îlots CpG (« microarray ») ou sur un génome entier ("deep sequecing"), entre une ou plusieurs conditions d’étude et une condition de référence.
Transcriptomique et génomique appliquée
