Cette formation a pour but d'initier les participants au domaine de l'analyse transcriptomique par la technologie des Puces à ADN. Le programme donnera aux participants la capacité d'évaluer l'intérêt d'une telle approche et de mettre en place une stratégie scientifique liée à un projet d'analyse transcriptomique par Puces à ADN.
En outre, les participants acquerront une vision critique des résultats générés par cette technologie et seront à même d'analyser des résultats de Puces à ADN. Une vision générale du domaine et de ses perspectives d'évolution complètera cette formation.

Des notions en biologie moléculaire et des connaissances de l'outil informatique (tableur Excel, traitement de textes Word, Internet) sont requis.

Théorie
Introduction sur les Puces à ADN.
Approches bio-informatiques pour la sélection des reporteurs.
Préparation des échantillons et considérations quantitatives.
Les différentes méthodes de marquages.
Méthodologies d'hybridation.
Acquisition et analyse des images.
Etudes critiques de cas d'école.
Traitement et normalisation des données.
Statistiques liées aux Puces à ADN.
Introduction aux plans d'expérience.
Gène ontologie
Stockage et gestion des données, recommandations MIAME.
Perspectives et évolution des Puces à ADN.
Démonstrations
Analyse ARNtot Agilent.
Marquage des sondes.
Hybridation.
Lecture et analyse des lames.